23andMe
- Acceda all’account e apra le Impostazioni.
- Trovi la sezione 23andMe Data e richieda il download dei dati grezzi.
- Scarichi il file .zip quando arriva l’e-mail e lo carichi così com’è.
Dati DNA supportati
Kantesti legge direttamente i file di dati grezzi dei principali servizi di test DNA consumer e i file VCF, oltre ai referti genetici di qualsiasi laboratorio in PDF o come foto. Ecco cosa è supportato e come ottenere il file.
| Origine | Tipo di file | Limite |
|---|---|---|
| Dati grezzi di 23andMe, AncestryDNA, MyHeritage, FTDNA, LivingDNA | .txt, .csv, .tsv, anche in archivio .zip o .gz | Un file, fino a 80 MB |
| VCF di un laboratorio o di un servizio di sequenziamento | .vcf, anche .vcf.gz | Un file, fino a 80 MB; rsID nella colonna ID |
| Referto genetico di qualsiasi laboratorio | PDF, JPG, PNG | Fino a 6 file; PDF fino a 20 MB, foto fino a 10 MB ciascuna |
| Righe di genotipo copiate da un referto | Testo incollato: rsID, cromosoma, posizione, genotipo | Fino a 2.000.000 di caratteri |
Ogni servizio consente di scaricare i dati grezzi dalle impostazioni dell’account. I nomi dei menu cambiano di tanto in tanto; i passaggi qui sotto descrivono il percorso abituale.
Il file viene letto sul server in un unico passaggio in streaming, quindi anche un export di 80 MB richiede pochi secondi. Vengono conservati solo i 334 marcatori del pannello; il resto del genoma non viene archiviato.
Array, referti e sequenziamento
I test DNA consumer sono array di genotipizzazione: leggono marcatori selezionati, non l’intero genoma, e non rilevano le varianti rare. Un referto è completo solo quanto il file su cui si basa, e i risultati clinicamente rilevanti vanno confermati con test genetici clinici.
Un esempio di interpretazione del test DNA, di referto DNA + sangue e di piano di integratori.