DNA Hub

Dữ liệu ADN được hỗ trợ

Diễn giải dữ liệu ADN thô bằng AI

Để diễn giải dữ liệu ADN thô, Kantesti đọc trực tiếp tệp dữ liệu thô của các dịch vụ xét nghiệm ADN tiêu dùng lớn và tệp VCF, cùng báo cáo di truyền từ bất kỳ phòng xét nghiệm nào dưới dạng PDF hoặc ảnh chụp. Dưới đây là các định dạng được hỗ trợ và cách lấy tệp.

Các tệp được hỗ trợ

NguồnTệpGiới hạn
Dữ liệu thô từ 23andMe, AncestryDNA, MyHeritage, FTDNA, LivingDNA.txt, .csv, .tsv, kể cả trong tệp .zip hoặc .gzMột tệp, tối đa 80 MB
VCF từ phòng xét nghiệm hoặc dịch vụ giải trình tự.vcf, kể cả .vcf.gzMột tệp, tối đa 80 MB; rsID nằm ở cột ID
Báo cáo di truyền từ bất kỳ phòng xét nghiệm nàoPDF, JPG, PNGTối đa 6 tệp; PDF tối đa 20 MB, mỗi ảnh tối đa 10 MB
Các dòng kiểu gen sao chép từ báo cáoVăn bản dán vào: rsID, nhiễm sắc thể, vị trí, kiểu genTối đa 2.000.000 ký tự

Từ bộ kit xét nghiệm ADN đến báo cáo di truyền

Bộ kit xét nghiệm ADN và ống nước bọt cạnh các tệp dữ liệu ADN thô TXT, CSV, VCF và ZIP đang tải lên máy chủ bảo mật
Tệp dữ liệu ADN thô từ các xét nghiệm ADN tiêu dùngHỗ trợ tệp thô từ 23andMe, AncestryDNA, MyHeritage, FamilyTreeDNA và LivingDNA, cũng như VCF, kể cả các tệp được nén dưới dạng .zip hoặc .gz.
Chip vi mảng định kiểu gen với các điểm màu và kính lúp hiển thị các cặp kiểu gen AG, CT, GG và AT
Chip định kiểu gen đọc ADN dưới dạng các cặp chữ cáiChip định kiểu gen ghi nhận mỗi dấu ấn dưới dạng một cặp chữ cái như AG hoặc CT, và các cặp này tạo nên tệp dữ liệu ADN thô. Kantesti đối chiếu tệp đó với 334 dấu ấn được tuyển chọn.
Các hàng cặp kiểu gen chảy qua phễu lọc vào chuỗi xoắn ADN có huy hiệu 334 của bảng dấu ấn được tuyển chọn
Tệp kiểu gen thô, được lọc còn 334 dấu ấn được tuyển chọnTệp ADN thô được phân tích trên máy chủ và đối chiếu với 334 dấu ấn được tuyển chọn thuộc 20 lĩnh vực sức khỏe. Sau đó mọi phát hiện của AI đều được kiểm tra với tệp.
Thẻ tệp ADN có ba dấu tích, đồng hồ đo ở vùng xanh và tấm khiên, thể hiện bước kiểm tra chất lượng dữ liệu ADN thô
Kiểm tra chất lượng tệp ADN thô đã tải lênTệp ADN thô được tải lên sẽ được đọc trên máy chủ, dù đến từ xét nghiệm ADN tiêu dùng hay tệp VCF. Mọi phát hiện của AI trong báo cáo đều được đối chiếu với tệp đó.

Cách tải xuống dữ liệu ADN thô

Mọi dịch vụ đều cho phép tải xuống dữ liệu thô trong phần cài đặt tài khoản. Tên menu đôi khi thay đổi; các bước dưới đây mô tả đường dẫn thông thường.

23andMe

  1. Đăng nhập và mở Settings.
  2. Tìm mục 23andMe Data và yêu cầu tải xuống dữ liệu thô.
  3. Tải tệp .zip xuống khi nhận được email. Tải tệp này lên nguyên trạng.

AncestryDNA

  1. Đăng nhập và mở phần cài đặt DNA của bài xét nghiệm.
  2. Chọn Download DNA data và xác nhận qua email nhận được.
  3. Tải lên tệp .zip đã tải xuống.

MyHeritage

  1. Mở menu DNA và vào Manage DNA kits.
  2. Chọn Download cho bộ kit và xác nhận qua email.
  3. Tải lên tệp .zip hoặc .csv.

FamilyTreeDNA

  1. Mở myDNA và kết quả nhiễm sắc thể thường (autosomal).
  2. Chọn Download Raw Data và chọn tệp build 37.
  3. Tải lên tệp .csv.gz.

LivingDNA

  1. Mở phần kết quả và mục tải xuống.
  2. Tải xuống tệp dữ liệu thô.
  3. Tải lên tệp .txt, .csv hoặc .zip.

VCF

  1. Đề nghị phòng xét nghiệm hoặc dịch vụ giải trình tự cung cấp tệp VCF.
  2. Đảm bảo cột ID chứa rsID.
  3. Tải lên tệp .vcf hoặc .vcf.gz.

Điều gì xảy ra khi tải tệp lên

Tệp được đọc trên máy chủ trong một lượt xử lý dạng luồng duy nhất, nên ngay cả tệp xuất 80 MB cũng chỉ mất vài giây. Chỉ 334 dấu ấn trong bảng được giữ lại; phần còn lại của bộ gen không được lưu trữ.

  • Định dạng và phiên bản bộ gen tham chiếu được tự động nhận diện.
  • Tỷ lệ gọi kiểu gen (call rate) và số dấu ấn của bảng được tìm thấy hiển thị trong báo cáo.
  • Tệp không đọc được hoặc không được hỗ trợ bị từ chối ngay lập tức, trước khi AI bắt đầu xử lý.
  • Báo cáo dạng PDF hoặc ảnh chụp được AI đọc trực tiếp, từng trang một.
Phần chất lượng dữ liệu trong báo cáo ADN của Kantesti

Chip định kiểu gen, báo cáo và giải trình tự

Xét nghiệm ADN tiêu dùng dùng chip định kiểu gen: chúng đọc các dấu ấn được chọn lọc chứ không phải toàn bộ bộ gen, và bỏ sót các biến thể hiếm. Báo cáo chỉ đầy đủ đến mức tệp dữ liệu phía sau cho phép, và các phát hiện cần can thiệp nên được xác nhận bằng xét nghiệm di truyền lâm sàng.

Xem báo cáo trông như thế nào

Bản diễn giải xét nghiệm ADN, báo cáo DNA + máu và kế hoạch thực phẩm bổ sung mẫu.