DNA Hub

対応する DNA データ

AI による DNA 生データの解釈

Kantesti の DNA 生データ解釈は、主要な消費者向け DNA 検査サービスの生データファイルと VCF ファイルを直接読み込み、あらゆる検査機関の遺伝子検査レポートも PDF または写真で受け付けます。ここでは対応形式とファイルの入手方法をご紹介します。

対応ファイル

提供元ファイル上限
23andMe、AncestryDNA、MyHeritage、FTDNA、LivingDNA の生データ.txt、.csv、.tsv(.zip または .gz 内も可)1 ファイル、最大 80 MB
検査機関またはシーケンシングサービスの VCF.vcf(.vcf.gz も可)1 ファイル、最大 80 MB。rsID は ID 列に記載
あらゆる検査機関の遺伝子検査レポートPDF、JPG、PNG最大 6 ファイル。PDF は各 20 MB まで、写真は各 10 MB まで
レポートからコピーした遺伝子型の行貼り付けテキスト:rsID、染色体、位置、遺伝子型最大 2,000,000 文字

DNA 検査キットから遺伝子検査レポートまで

DNA 検査キットと唾液採取チューブの横で、TXT、CSV、VCF、ZIP の DNA 生データファイルが安全なサーバーにアップロードされる様子
消費者向け DNA 検査の DNA 生データファイル23andMe、AncestryDNA、MyHeritage、FamilyTreeDNA、LivingDNA の生データファイルと VCF に対応しており、.zip や .gz に圧縮されたファイルも利用できます。
色付きのスポットが並ぶ遺伝子型解析用マイクロアレイチップと、遺伝子型ペア AG、CT、GG、AT を映す虫眼鏡
遺伝子型解析アレイは DNA を文字のペアとして読み取る遺伝子型解析アレイは各マーカーを AG や CT といった文字ペアで報告し、これらのペアが DNA 生データファイルを構成します。Kantesti はこのファイルを厳選された 334 のマーカーと照合します。
遺伝子型ペアの行がフィルターの漏斗を通って DNA 二重らせんへ流れ込み、厳選マーカーパネルを示す 334 のバッジが付いた図
生の遺伝子型ファイルを解析し、厳選 334 マーカーに絞り込みDNA 生データファイルはサーバー上で解析され、20 の健康領域にわたる厳選された 334 のマーカーと照合されます。その後、AI の所見はすべてこのファイルと照合されます。
3 つのチェックマーク付き DNA ファイルカード、緑のゾーンを指すゲージ、盾で DNA 生データの品質チェックを表した図
アップロードされた DNA 生データファイルの品質チェックアップロードされた DNA 生データファイルは、消費者向け DNA 検査由来でも VCF でも、サーバー上で読み込まれます。レポート内の AI の所見はすべて、このファイルと照合されます。

DNA 生データのダウンロード方法

各サービスでは、アカウント設定から生データをダウンロードできます。メニュー名は変更されることがあるため、以下は一般的な手順です。

23andMe

  1. サインインして「Settings」(設定)を開きます。
  2. 「23andMe Data」セクションで生データのダウンロードをリクエストします。
  3. メールが届いたら .zip ファイルをダウンロードし、そのままアップロードします。

AncestryDNA

  1. サインインして、検査の DNA 設定を開きます。
  2. 「Download DNA data」を選択し、届いたメールで確認します。
  3. ダウンロードした .zip ファイルをアップロードします。

MyHeritage

  1. DNA メニューを開き、「DNA キットの管理」に進みます。
  2. 該当キットの「ダウンロード」を選択し、メールで確認します。
  3. .zip または .csv ファイルをアップロードします。

FamilyTreeDNA

  1. myDNA を開き、常染色体の検査結果を表示します。
  2. 「Download Raw Data」を選択し、build 37 のファイルを選びます。
  3. .csv.gz ファイルをアップロードします。

LivingDNA

  1. 検査結果を開き、ダウンロードセクションに進みます。
  2. 生データファイルをダウンロードします。
  3. .txt、.csv、.zip のいずれかのファイルをアップロードします。

VCF

  1. 検査機関またはシーケンシングサービスに VCF ファイルを依頼します。
  2. ID 列に rsID が含まれていることを確認します。
  3. .vcf または .vcf.gz ファイルをアップロードします。

アップロード後の処理

ファイルはサーバー上で 1 回のストリーミング処理により読み込まれるため、80 MB のエクスポートファイルでも数秒で完了します。保持されるのは 334 のパネルマーカーのみで、それ以外のゲノム情報は保存されません。

  • ファイル形式とゲノムビルドは自動的に判別されます。
  • コールレートと検出されたパネルマーカー数は、レポートに表示されます。
  • 読み取れないファイルや非対応のファイルは、AI 処理の前に即座に拒否されます。
  • PDF や写真のレポートは、AI が 1 ページずつ直接読み取ります。
Kantesti の DNA レポートのデータ品質セクション

アレイ、レポート、シーケンシング

消費者向け DNA 検査は遺伝子型解析アレイです。ゲノム全体ではなく選択されたマーカーを読み取るもので、まれなバリアントは検出できません。レポートの網羅性は元となるファイルに左右されるため、対応が必要な所見は臨床遺伝学的検査で確認してください。

レポートの実例をご覧ください

DNA 検査解釈、DNA + 血液レポート、サプリメントプランのサンプルです。