DNA Hub

Desteklenen DNA verileri

Yapay zekâ ile ham DNA verisi yorumlama

Kantesti, başlıca tüketiciye yönelik DNA hizmetlerinden alınan ham DNA verisi dosyalarını ve VCF dosyalarını doğrudan, herhangi bir laboratuvarın genetik raporlarını ise PDF veya fotoğraf olarak okur. Aşağıda hangi dosyaların desteklendiğini ve dosyayı nasıl edinebileceğinizi bulabilirsiniz.

Desteklenen dosyalar

KaynakDosyaSınır
23andMe, AncestryDNA, MyHeritage, FTDNA, LivingDNA ham verisi.txt, .csv, .tsv; .zip veya .gz içinde de olabilirTek dosya, en fazla 80 MB
Laboratuvar veya dizileme hizmetinden alınan VCF.vcf, ayrıca .vcf.gzTek dosya, en fazla 80 MB; rsID'ler ID sütununda
Herhangi bir laboratuvardan genetik raporPDF, JPG, PNGEn fazla 6 dosya; PDF en fazla 20 MB, fotoğrafların her biri en fazla 10 MB
Bir rapordan kopyalanan genotip satırlarıYapıştırılmış metin: rsID, kromozom, konum, genotipEn fazla 2.000.000 karakter

DNA test kitinden genetik rapora

DNA test kiti ve tükürük tüpünün yanında güvenli sunucuya yüklenen TXT, CSV, VCF ve ZIP ham DNA veri dosyaları
Tüketiciye yönelik DNA testlerinden ham DNA veri dosyaları23andMe, AncestryDNA, MyHeritage, FamilyTreeDNA ve LivingDNA ham dosyaları ile VCF desteklenir; .zip veya .gz olarak sıkıştırılmış dosyalar da buna dahildir.
Renkli noktalı genotipleme mikrodizi çipi ve AG, CT, GG ile AT genotip çiftlerini gösteren bir büyüteç
Genotipleme çipi DNA'yı harf çiftleri hâlinde okurGenotipleme çipleri her belirteci AG veya CT gibi bir harf çifti olarak raporlar; ham DNA veri dosyası bu çiftlerden oluşur. Kantesti bu dosyayı özenle seçilmiş 334 belirteçle karşılaştırır.
Filtre hunisinden geçip 334 rozetli DNA sarmalına akan genotip çifti satırları: özenle seçilmiş belirteç paneli
Ham genotip dosyası, özenle seçilmiş 334 belirtece indirgenirHam DNA dosyası sunucuda ayrıştırılır ve 20 sağlık alanındaki özenle seçilmiş 334 belirteçle eşleştirilir. Ardından yapay zekânın her bulgusu dosyayla kontrol edilir.
Üç onay işareti, yeşil bölgede bir gösterge ve kalkan bulunan DNA dosya kartı: ham DNA verisi kalite kontrolü
Yüklenen ham DNA dosyasının kalite kontrolüYüklenen ham DNA dosyası, ister tüketiciye yönelik bir DNA testinden ister VCF'den gelsin, sunucuda okunur. Rapordaki yapay zekâ bulgularının her biri bu dosyayla kontrol edilir.

Ham DNA verisi nasıl indirilir?

Her hizmet, hesap ayarlarında ham veri indirme seçeneği sunar. Menü adları zaman zaman değişebilir; aşağıdaki adımlar olağan yolu anlatır.

23andMe

  1. Oturum açın ve Settings (Ayarlar) sayfasına gidin.
  2. 23andMe Data bölümünü bulun ve ham veri indirme talebinde bulunun.
  3. E-posta geldiğinde .zip dosyasını indirin ve olduğu gibi yükleyin.

AncestryDNA

  1. Oturum açın ve testin DNA ayarlarını açın.
  2. Download DNA data (DNA verilerini indir) seçeneğini seçin ve gelen e-postadan onaylayın.
  3. İndirilen .zip dosyasını yükleyin.

MyHeritage

  1. DNA menüsünü açın ve DNA kitlerini yönet (Manage DNA kits) sayfasına gidin.
  2. İlgili kit için İndir (Download) seçeneğini seçin ve e-postayla onaylayın.
  3. .zip veya .csv dosyasını yükleyin.

FamilyTreeDNA

  1. myDNA bölümünü ve otozomal sonuçları açın.
  2. Download Raw Data (Ham veriyi indir) seçeneğini seçin ve build 37 dosyasını alın.
  3. .csv.gz dosyasını yükleyin.

LivingDNA

  1. Sonuçlarınızı ve indirme bölümünü açın.
  2. Ham veri dosyasını indirin.
  3. .txt, .csv veya .zip dosyasını yükleyin.

VCF

  1. VCF dosyasını laboratuvardan veya dizileme hizmetinden isteyin.
  2. ID sütununda rsID'lerin yer aldığından emin olun.
  3. .vcf veya .vcf.gz dosyasını yükleyin.

Dosyayı yüklediğinizde ne olur?

Dosya sunucuda tek geçişte, akış hâlinde okunur; bu sayede 80 MB'lık bir dışa aktarım bile saniyeler sürer. Yalnızca 334 panel belirteci saklanır; genomun geri kalanı depolanmaz.

  • Dosya biçimi ve referans genom sürümü otomatik olarak algılanır.
  • Çağrı oranı ve bulunan panel belirteci sayısı raporda gösterilir.
  • Okunamayan veya desteklenmeyen bir dosya, herhangi bir yapay zekâ işlemi başlamadan hemen reddedilir.
  • PDF veya fotoğraf olarak yüklenen bir rapor, yapay zekâ tarafından sayfa sayfa doğrudan okunur.
Kantesti DNA raporunun veri kalitesi bölümü

Çipler, raporlar ve dizileme

Tüketiciye yönelik DNA testleri genotipleme çipleridir: genomun tamamını değil, seçili belirteçleri okurlar ve nadir varyantları kaçırırlar. Bir rapor ancak dayandığı dosya kadar eksiksiz olabilir; eyleme dönük bulgular klinik genetik testlerle teyit edilmelidir.

Raporun nasıl göründüğünü inceleyin

Örnek bir DNA testi yorumlama raporu, DNA + kan raporu ve takviye planı.