DNA Hub

Támogatott DNS-adatok

Nyers DNS-adatok AI-alapú értelmezése

A Kantesti közvetlenül beolvassa a nagy fogyasztói DNS-szolgáltatások nyers DNS-adatait és a VCF-fájlokat, valamint bármely laboratórium genetikai leletét PDF-ként vagy fényképként. Itt megtudhatja, mit támogatunk, és hogyan szerezheti be a fájlt.

Támogatott fájlok

ForrásFájlKorlát
Nyers adatok: 23andMe, AncestryDNA, MyHeritage, FTDNA, LivingDNA.txt, .csv, .tsv, .zip vagy .gz archívumban isEgy fájl, legfeljebb 80 MB
VCF laboratóriumtól vagy szekvenáló szolgáltatótól.vcf, illetve .vcf.gzEgy fájl, legfeljebb 80 MB; rsID-k az ID oszlopban
Bármely laboratórium genetikai leletePDF, JPG, PNGLegfeljebb 6 fájl; PDF legfeljebb 20 MB, fényképek egyenként legfeljebb 10 MB
Leletből másolt genotípussorokBeillesztett szöveg: rsID, kromoszóma, pozíció, genotípusLegfeljebb 2 000 000 karakter

A DNS-tesztkészlettől a genetikai jelentésig

DNS-tesztkészlet, nyálmintacső és TXT-, CSV-, VCF-, ZIP-formátumú nyers DNS-adatfájlok feltöltése biztonságos szerverre
Fogyasztói DNS-tesztek nyers adatfájljaiTámogatjuk a 23andMe, az AncestryDNA, a MyHeritage, a FamilyTreeDNA és a LivingDNA nyers fájljait, valamint a VCF-et, .zip vagy .gz formátumba tömörítve is.
Genotipizáló mikrochip színes pontokkal és nagyító, alatta az AG, CT, GG és AT genotípuspárok
A genotipizáló chip betűpárokként olvassa a DNS-tA genotipizáló chipek minden markert betűpárként adnak meg, például AG vagy CT, és ezek a párok alkotják a nyers DNS-adatfájlt. A Kantesti ezt a fájlt 334 válogatott markerrel veti össze.
Genotípuspárok sorai egy szűrőtölcséren át DNS-spirálba áramlanak, a 334-es jelzés a válogatott markerpanelt mutatja
A nyers genotípusfájl 334 válogatott markerre szűrveA nyers DNS-fájlt a szerveren dolgozzuk fel, és 20 egészségterület 334 válogatott markerével vetjük össze. Ezután minden AI-eredményt ellenőrzünk a fájlon.
DNS-fájl kártya három pipával, zöld zónában álló mérőműszer és pajzs: a nyers DNS-adatok minőségellenőrzése
A feltöltött nyers DNS-fájl minőségellenőrzéseA feltöltött nyers DNS-fájlt a szerveren olvassuk be, akár fogyasztói DNS-tesztből, akár VCF-ből származik. A jelentés minden AI-eredményét ezzel a fájllal ellenőrizzük.

Hogyan töltheti le a nyers DNS-adatokat

Minden szolgáltatás lehetővé teszi a nyers adatok letöltését a fiókbeállításokban. A menük neve időről időre változik; az alábbi lépések a szokásos utat írják le.

23andMe

  1. Jelentkezzen be, és nyissa meg a beállításokat (Settings).
  2. Keresse meg a 23andMe Data részt, és kérje a nyers adatok letöltését.
  3. Amikor megérkezik az e-mail, töltse le a .zip-fájlt. Töltse fel változtatás nélkül.

AncestryDNA

  1. Jelentkezzen be, és nyissa meg a teszt DNS-beállításait.
  2. Válassza a Download DNA data lehetőséget, és erősítse meg a kapott e-mailben.
  3. Töltse fel a letöltött .zip-fájlt.

MyHeritage

  1. Nyissa meg a DNS menüt, és lépjen a DNS-készletek kezelése (Manage DNA kits) oldalra.
  2. Válassza a készletnél a letöltést (Download), és erősítse meg e-mailben.
  3. Töltse fel a .zip- vagy .csv-fájlt.

FamilyTreeDNA

  1. Nyissa meg a myDNA felületet és az autoszomális eredményeket.
  2. Válassza a Download Raw Data lehetőséget, és a build 37-es fájlt.
  3. Töltse fel a .csv.gz-fájlt.

LivingDNA

  1. Nyissa meg az eredményeit és a letöltési részt.
  2. Töltse le a nyers adatfájlt.
  3. Töltse fel a .txt-, .csv- vagy .zip-fájlt.

VCF

  1. Kérje el a VCF-fájlt a laboratóriumtól vagy a szekvenáló szolgáltatótól.
  2. Győződjön meg róla, hogy az ID oszlop rsID-ket tartalmaz.
  3. Töltse fel a .vcf- vagy .vcf.gz-fájlt.

Mi történik a feltöltéskor

A fájlt a szerveren egyetlen folyamatos (streaming) olvasással dolgozzuk fel, így még egy 80 MB-os export is csak másodperceket vesz igénybe. Csak a 334 panelmarkert őrizzük meg; a genom többi részét nem tároljuk.

  • A fájlformátumot és a genomverziót automatikusan felismerjük.
  • A hívási arány és a megtalált panelmarkerek száma megjelenik a jelentésben.
  • Az olvashatatlan vagy nem támogatott fájlt azonnal elutasítjuk, még mielőtt az AI munkához látna.
  • A PDF- vagy fényképes leletet az AI közvetlenül, oldalanként olvassa be.
Kantesti DNS-jelentés adatminőségi szakasza

Chipek, leletek és szekvenálás

A fogyasztói DNS-tesztek genotipizáló chipek: kiválasztott markereket olvasnak, nem a teljes genomot, és a ritka variánsokat nem észlelik. A jelentés csak annyira teljes, amennyire a mögötte álló fájl, a klinikailag releváns eredményeket pedig klinikai genetikai vizsgálattal célszerű megerősíteni.

Nézze meg, hogyan néz ki a jelentés

Minta DNS-teszt-értelmezés, DNS + vér jelentés és étrend-kiegészítő terv.